Définition
L'agarose est un sucre complexe naturel, extrait d'algues rouges, qui se présente sous forme de poudre blanche. Lorsqu'on le mélange à un liquide et qu'on le chauffe, il forme en refroidissant une gelée ferme et poreuse qui agit comme un tamis microscopique pour trier les molécules.
L'essentiel
- C'est un composant purifié de l'agar-agar.
- Il sert de tamis moléculaire pour séparer l'ADN et les protéines.
- C'est un produit naturel, non toxique et biodégradable.
Formule et propriétés
Le terme provient du mot malais agar-agar (désignant l'algue dont il est issu) associé au suffixe chimique -ose, utilisé pour désigner les glucides (sucres).
Comment l'utiliser
- Préparation d'un gel pour une électrophorèse afin de vérifier la taille de fragments d'ADN après une PCR.
- Utilisation comme support solide pour la culture de certains micro-organismes en microbiologie.
- Composant de billes de purification pour séparer des protéines par chromatographie.
Utilisations
On l'utilise principalement en biotechnologie et en biochimie. Son usage le plus courant reste l'électrophorèse : on fait migrer des molécules chargées électriquement à travers le gel d'agarose pour les séparer selon leur taille (les petites circulent plus vite que les grandes à travers les mailles du gel).
Dangers et précautions
Il est crucial de bien dissoudre la poudre dans un tampon adapté en chauffant le mélange jusqu'à ce qu'il devienne parfaitement limpide. Attention à ne pas couler le gel trop chaud dans les moules en plastique pour éviter de les déformer, et veillez à adapter la concentration d'agarose (le pourcentage) à la taille des molécules que vous souhaitez analyser.
Substances liées
Stockage et élimination
Si vous débutez en laboratoire, portez une attention particulière à la température du liquide avant de le verser. Pour visualiser l'ADN dans le gel, vous devrez ajouter un agent colorant ; manipulez-le avec précaution car ces agents sont souvent bien plus dangereux que l'agarose lui-même.
Questions fréquentes
Quelle est la différence entre l'agarose et l'agar-agar ?
L'agar-agar est un mélange brut utilisé en cuisine, tandis que l'agarose est sa fraction la plus pure, optimisée pour ne pas perturber les expériences scientifiques.
Pourquoi le gel d'agarose est-il fragile ?
Sa structure tient par des liaisons hydrogène physiques ; s'il est trop peu concentré ou manipulé brutalement, le réseau se casse facilement.
Peut-on réutiliser un gel d'agarose ?
En théorie oui, en le refaisant fondre, mais en pratique c'est déconseillé car les impuretés et les sels du tampon s'accumulent, faussant les résultats suivants.